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如果在尝试注册12306账号时，系统显示手机号已被注册，可能会产生以下后果。
1、无法注册新账号：如果手机号已经被注册过，则无法使用该手机号再次进行注册。
2、账号安全受影响：无法确定原账号的安全性，可能存在账号被盗用或个人信息泄露的风险，如果其他人使用您的手机号注册了账号，那么您的个人信息可能被不法分子获取并利用，导致账号安全问题。
3、干扰正常购票出行计划：如果无法成功注册账号，就无法正常购票，从而影响到出行计划。
如果遇到这种情况，建议立即联系12306客服，确认账号安全并尝试找回原有账号或注销原有账号后重新注册，也可以尝试使用其他手机号进行注册，为了确保账号安全，建议在注册时设置复杂密码，并妥善保管个人信息。
仅供参考，具体后果可能会因实际情况而异，如有更专业具体的需求，可以咨询相关领域的专家。